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博文

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科研文献审稿经验心得分享

初衷 在实验室学习的过程中,经常能从导师那里接到一些审稿文章,而后进行一些审稿工作。开始几次审稿的时候我自己都还没有发过文章,文献读的也少,因此,吃力程度可想而之。借助google在网上固然可以得到很多相关的资料,其中很多帮助很大,但是大部分资料都是审稿回复的一些基本语句,还有就是,学术大牛对在投文章如何看待审稿意见的建议。 我一直以为对于任何事物的学习过程而言,开始的时候总是有其特殊的困难,因此对于开始一项学习而言,需要最入门简单的教程。而对于审稿工作,每个研究生第一次接触的时候总会有这样那样的困惑或者是更一般的无从下手的迷茫。笔者自己面对新工作的时候经常会不知道干什么而拖到Deadline的最后一刻,利用Deadline生产力原则来完成工作,不过我知道,这当然是不好的,事物的学习还是遵从它自然的规则更好。因此,写这篇随笔来记录一下自己的审稿心得,一方面是对自己学习的总结,另一方面希望对初次进行审稿的研究生同学提供一点点帮助。 审稿的基本概念 考虑到这是一篇基础性文章,请允许我不厌其烦的介绍审稿的诸多细节,虽然对于很多人特别是经历过科技文章写作投稿的人来说,这些都是无意义的堆砌,但是,我回忆自己学习经历的初期,确实对“审稿”,“期刊”,“编辑”这些基本概念也是要一点点的查过来的,因此我想对于初学者,这种基本的介绍还是有帮助的。 首先是出版社(比如 Elsevier, Wiley等都是著名的科技文献出版社),出版社是一个商业组织,出版社旗下有很多的期刊,这些期刊上面刊登着世界各地的研究者以科技论文的形式发表的自己的研究成果。不同的期刊关注科学研究的不同领域,而出版社负责组织这些期刊。可想而知,科学研究的内容是一般是复杂的,而且针对具体的领域又很有深度,管理好一个期刊使期刊可以真正促进对应的学科进步是一件困难的事情。另一方面,出版社也非常关心的一件事情是如何保证自己期刊文章的质量。而审稿制度就可以在一定程度上解决这个问题。 简单说明一下文章发表的流程,从文章产生的角度,首先最开始当然是研究者选择课题,进行研究,并将研究成果以科技论文的形式撰写出来并投稿到自己想要发表的期刊。然后期刊的编辑会接收到文章,编辑的工作就是初步检查文章的内容并确定这篇文章是否符合期刊的发表要求。由于文章多涉及专业的研究内容,因此,编辑在确定文章的研究课题大致符合期刊要求之后,需要进...

Webster Merriam 字典的Alfred扩展

我很喜欢Webster Merriam字典的音节标注,因为我发现了解音节的情况下非常有利于单词的记忆。 在这个功能的驱使下,入手了词典的手机应用,虽然功能不错,但是不够用。很难想象我自己对着电脑看到生词再用手机查吧,而且,Merriam Webster的网页超级慢,有时打不开,而且,还有广告。所以查生词打断思路的事情时有发生。 平时使用电脑看英文资料的时候,我手边使用的alfred的有道字典扩展,虽然非常好用,但是唯一感觉美中不足的是缺少音节功能。 如果是字典应用或者扩展的话,网上有一大堆,而且其中不乏大神的神作,发音功能也好,全字典也好,各种强大的功能都有实现,但是,唯独我自己的这个需求太过于小众了。我只是想能方便快速的知道音节。 所以,自己动手造。 当然,不是凭空造了,总要有个参考,毕竟我只是想查一下音节而已,总要有个思路和参考才好。 https://github.com/FushenYang/hpydict 这是我在网山找到的最相关的项目了,功能很强大,还能发音,fork之后发现使用ruby写的,我自己的ruby水平一半,感觉会很吃力。直接拿来用都感觉会不顺利。 不过这个项目给出了一个很好的思路,注册一个Merriam Webster开发者账号就能简单到调用词典信息了。 所以,我就简单的封装了一下做了自己的alfred扩展。如图: 第一行显示 单词,音标,词性,音节,第二行显示解释; 工作流项目地址:  https://github.com/FushenYang/websterdic 做的很粗糙,但是我自己就够用了,如果需要更强的功能建议参考hpydict项目自己修改。如果只是要使用,记得自己注册一个Webster Merriam Dictionary 开发者账号,然后将key填写到alfred工作流的修改界面。

输入法切换的alfred扩展

输入法切换一直是我自己会碰到的小问题。其实也不大,Option+Blank在英文和中文中切换其实没有问题。本来我就只有两种文字,随时注意一下右上角就可以处理好。 不过,最常见的问题是,输入了几个字,一看错了,然后删除,然后换输入法。浪费了很多时间吗?我不太清楚,不过心情会不好~输入的连贯性没有了。 因为最近入手了alfred,所以觉得应该改进一下,参考教程,开始做。 http://support.alfredapp.com/tutorials:hotkeys 目前我的alfred在commad+blank上,所以可以把option和control给两种输入法。(spotlight就不用了,因为alfred更好用,当然,找文件还是spotlight好用,所以不给他快捷键了) http://www.alfredforum.com/topic/4978-changing-keyboard-input/ 这个帖子里有些代码现成的,但是,想了一下,还是花个几分钟看看AppleScript吧。感觉很简单,这种输入方式还真是有意思,不过感觉初学者学习编程还是接触些“更规范”的语言比较好,好了,as的hello word完成。 display dialog "your text here" with icon stop buttons {"OK"} 上截图: 这样就好了。 然后就是把修改输入方式的代码粘贴过来。 然后,修改权限,把语言换成"U.S."就OK了~ 大功告成~ 写到最后: 做完了这个功能感觉自己其实不太想用……control键的位置也不太好找,而且,输入法那个地方会闪烁一下,感觉更怪了,不过先留着这个工作流吧,也许哪天会有别的想法。

Bash遍历文件

非常简单的学习笔记,任务也很简单。 我在网上下载了一个字幕文件合集,字幕格式非常齐全,ass和srt还有中英繁简的单独和混排。 我要做的是遍历整个目录,然后把我需要的中英.srt字幕筛选出来(万幸,字幕文件命名是很规范的,因此不需要检测文件内容,如果检测文件内容的话,那就麻烦了)。 废话不多,上代码~ dirs=`ls -d */` for dir in $dirs do         for f in `ls $dir`         do                 case "$f" in                         *简体\&英文.srt)                         cp ./$dir/$f ~/;;                         *)                         continue;;                 esac         done done 一些说明: 1. 由于有文件夹嵌套,所以dirs保存的是所有目录的名字,其中-d参数保证只是保存名字; 2. $f中是遍历所有的文件,其中&因为有特殊含义,因此需要转义;(可以参考:http://www.tldp.org/LDP/abs/html/escapingsection....

some graph tool for science works

Many times, we need nice figure to show our data. In general, Origin is good enough for me (I am a PhD student now), but some I want some more beautiful graphs. Herein, I note same software here. Prism, a origin-like tool  http://www.graphpad.com/scientific-software/prism/#7 canvas X http://www.canvasx.com/en/support/canvas-11 irfanview http://www.irfanview.com/ A very useful tool to compress figure. gnuplot http://www.gnuplot.info/ I usually use origin to plot my figures. But it is a not free software and has not mac version. Gnuplot is small and command line based, and I think that it may be a good tool to complete my figures.